Over ons onderzoek
Onderzoeksafdelingen en instituten
De masterspecialisatie in Microbiology wordt aangeboden in nauwe samenwerking met de onderzoeksgroepen Microbiology aan de Radboud Universiteit en Medical Microbiology aan het Radboudumc. We werken samen met collega’s van het Radboud Institute for Biological and Environmental Sciences (RIBES), de afdeling Medical Microbiology van het Radboudumc en complementaire (inter)nationale experts van SIAM, NESSC en verschillende Max Planck Instituten.
Afdeling Microbiology
De onderzoeksgroep Microbiology aan de Radboud Universiteit werkt in de voorhoede van milieumicrobiologie en is gespecialiseerd in de ontdekking van ‘onmogelijke’, nieuwe anaerobe micro-organismen. Het laboratorium is uitgerust met geavanceerde bio-reactoren, elektronenmicroscopie, GC-MS, metagenomics en metaproteomics faciliteiten om micro-organismen te kweken en te bestuderen die bijdragen aan een beter milieu door het verbruiken van broeikasgassen en stikstofhoudende verontreinigingen.
Onze afdeling Microbiologie heeft de meest prestigieuze wetenschapsprijzen ontvangen, waaronder drie ERC Advanced Grants, een Spinozaprijs, en Gravitation Grants. Ook hebben veel studenten prijzen gewonnen voor beste scriptie, poster en paper.
Afdeling Medical Microbiology
Bij de afdeling Medical Microbiology van het Radboudumc voeren we diagnostisch onderzoek uit en geven we behandeladviezen. We werken aan het opsporen, diagnosticeren en behandelen van infectieziekten veroorzaakt door micro-organismen, zoals bacteriën, virussen, parasieten en schimmels.
Radboud Institute for Biological and Environmental Sciences (RIBES)
Het Radboud Institute for Biological and Environmental Sciences (RIBES) streeft ernaar wereldleidend onderzoek te doen om de reactie van het natuurlijke milieu op menselijke impact te begrijpen. RIBES onderzoekt stress- en aanpassingsprocessen in zwaar getroffen ecosystemen. Dit nieuwsgierigheidsgedreven, fundamentele onderzoek is verweven met innovatieve toepassingen in zowel de industrie als de samenleving, met een focus op het beperken van ecosysteemdegradatie en het vinden van oplossingen om het natuurlijke milieu te herstellen.
RIBES is (inter)nationaal uniek, omdat het onderzoek drie grote groepen organismen (micro-organismen, planten en dieren) omvat en bijna alle niveaus van biologische organisatie bestrijkt.
Onderzoeksthema's
Tijdens je master specialisatie in Microbiology kun je ervoor kiezen om je te richten op een van de volgende thema's als onderwerp van je onderzoeksstage:
Milieumicrobiologie & Biotechnologie
Microbiologie heeft het potentieel om gangbare energie-intensieve chemische processen te vervangen door duurzamere oplossingen. De Radboud Universiteit werkt nauw samen met milieuwetenschappers, dier-ecologen en industriële partners om energie-efficiënte en milieuvriendelijke oplossingen te creëren voor maatschappelijke afvalproblemen.
Voor studenten die geboeid zijn door vragen zoals: Hoe werkt leven zonder zuurstof? Hoe bepalen mondiale biogeochemische (nutriënten) cycli de werking van de aarde? Kunnen we micro-organismen gebruiken om een duurzamere afvalwaterindustrie te creëren? Hoe breken micro-organismen milieuverontreinigende stoffen en giftige chemicaliën af?
Je zult onderzoek doen op het snijvlak van microbiologie, milieuwetenschappen en biochemie. De onderzoeksvragen bevatten verschillende niveaus, van het verkrijgen van fundamenteel inzicht in het energiemetabolisme van bacteriën tot hun toepassing in de afvalwaterbehandeling.
Immunology
Een beter begrip van afweermechanismen zal leiden tot de ontwikkeling van verbeterde vaccins tegen micro-organismen.
Voor studenten die geboeid zijn door vragen zoals: Waarom maken sommige bacteriën ons ziek terwijl andere dat niet doen? Hoe omzeilen bacteriën ons immuunsysteem? Wat zijn de mechanismen van menselijke verdediging tegen micro-organismen?
Je zult onderzoek doen op het snijvlak van microbiologie, immunologie en celbiologie, en kunt bijvoorbeeld werken aan hoe micro-organismen worden herkend door het afweersysteem van de host.
Molecular Microbiology
Het begrijpen van interacties tussen host en ziekteverwekker is fundamenteel voor de ontwikkeling van nieuwe antibiotica en de verbetering van vaccins.
Voor studenten die geboeid zijn door vragen zoals: Hoe kunnen micro-organismen in het menselijk lichaam overleven en hoe veroorzaken ze ziektes? Wat vertelt genregulatie ons over hun pathogene capaciteiten? Kunnen microbiële genomen ons helpen bepalen hoe micro-organismen interageren met menselijke hostcellen?
Je zult onderzoek doen op het snijvlak van microbiologie, moleculaire biologie en genetica, en kunt bijvoorbeeld werken aan functionele gen-analyse door mutagenesestudies, en aan de interactie tussen epitheelcellen en pathogene bacteriën. Radboudumc werkt samen met gezondheidsinstituten zoals het RIVM (Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu) en met industriële partners.
Medical Microbiology & Virology
Pathogene micro-organismen zijn een belangrijke oorzaak van morbiditeit en mortaliteit wereldwijd. Diepgaande inzichten - van molecuul tot mens - zijn nodig om microbiële infecties effectief te bestrijden.
Voor studenten die geïntrigeerd zijn door vragen zoals: Hoe kunnen we microbiële infecties behandelen? Hoe ontstaat medicijnresistentie? Hoe veroorzaakt een virus ziekte? En hoe kunnen we infectie voorkomen door vaccinatie?
Je zult onderzoek doen op het snijvlak van klinische microbiologie, virologie, parasitologie, genetica en genomica. Onderzoeksvragen kunnen zich richten op moleculaire mechanismen van microbiële infectie en immuunafweer, evenals toepassingen in diagnostiek, en de ontwikkeling van vaccins en medicijnen.
Onderzoeksfaciliteiten
RIBES-onderzoekers maken gebruik van state-of-the-art moleculaire, analytische en microscopische faciliteiten in het moderne Huygens-gebouw van de Radboud Universiteit. Nieuwe kassen en groeikamers zijn speciaal ontworpen voor de onderzoeksbehoeften van RIBES en zijn operationeel sinds 2014.
Kas
In juli 2014 werd een nieuw kascomplex in gebruik genomen. De acht groeikamers variëren van 160 tot 240 m2. Twee kleine compartimenten zijn bestemd voor klimaatkasten. De kas is voorzien van een geavanceerd klimaatregelsysteem, schaduw en energiebesparende schermen. Regenwater dat van het kasdak komt, wordt opgevangen in bassins en na UV-behandeling gebruikt voor het bewateren van de planten.
Phytotron
In de Experimentele Tuin is de unieke Nijmeegse Phytotron een experimentele faciliteit met containers voor ecologische studies op mesocosmos-schaal. Gepositioneerd onder een regenscherm worden langetermijnstudies uitgevoerd onder omgevingsomstandigheden, met water geleverd via een geautomatiseerd druppelirrigatiesysteem. De Phytotron is ontworpen voor studies naar ondergrondse processen, inclusief een minirhizotron-systeem voor wortelobservaties. Het is een unieke onderzoeksfaciliteit omdat plantengroei en ondergrondse wortelinteractie kunnen worden bestudeerd in grote gecompartimenteerde containers zonder de planten te belasten of destructieve methoden te gebruiken.
Experimentele Tuin
Het experimentele veld is ongeveer 7500 m2 groot, inclusief kleinere en grotere vijvers, en is geschikt voor diverse veldexperimenten.